Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC12Q8WUD4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC12Q8WUD4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms