Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX29Q8TEQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms