Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
RB1CC1Q8TDY2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RB1CC1Q8TDY2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms