Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF398Q8TD17 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF398Q8TD17 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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