Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB33

LINC01560, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01560, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01560Q8TB33 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01560Q8TB33 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC01560Q8TB33 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms