Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD1Q8NHV4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEDD1Q8NHV4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms