Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SPTSSBQ8NFR3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms