Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHDC9Q8NEP7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHDC9Q8NEP7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms