Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCPH1Q8NEM0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCPH1Q8NEM0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms