Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC112Q8NEF3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC112Q8NEF3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms