Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG2Q8NC44 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RETREG2Q8NC44 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms