Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD53Q8N9V6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD53Q8N9V6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms