Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ANKRD42Q8N9B4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms