Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBR7Q8N806 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBR7Q8N806 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms