Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMCO5AQ8N6Q1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMCO5AQ8N6Q1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms