Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDCL2Q8N4E4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCL2Q8N4E4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms