Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC43Q8N309 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC43Q8N309 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC43Q8N309 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRC43Q8N309 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC43Q8N309 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC43Q8N309 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms