Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLF2Q8IX21 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLF2Q8IX21 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms