Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC117Q8IWD4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC117Q8IWD4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms