Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU68

TMC8, Transmembrane channel-like protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC8Q8IU68 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC8Q8IU68 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC8Q8IU68 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC8Q8IU68 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC8Q8IU68 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC8Q8IU68 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMC8Q8IU68 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC8Q8IU68 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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