Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNL1Q8IU54 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNL1Q8IU54 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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