Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NME9Q86XW9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NME9Q86XW9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms