Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX32Q86XE0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX32Q86XE0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms