Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNMA8AQ86V59 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8AQ86V59 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms