Protein–RNA interactions for Protein: Q86T82

USP37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP37Q86T82 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP37Q86T82 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP37Q86T82 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms