Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTU1Q7Z7A3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU1Q7Z7A3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms