Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YTHDF3Q7Z739 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
YTHDF3Q7Z739 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms