Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM47EQ6ZV65 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM47EQ6ZV65 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms