Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC149Q6ZUS6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms