Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC00299Q6ZSB3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms