Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPOCD1Q6ZMY3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms