Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDZRN4Q6ZMN7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms