Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HACD2Q6Y1H2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD2Q6Y1H2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms