Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GDPD4Q6W3E5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDPD4Q6W3E5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms