Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA5Q6Q788 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOA5Q6Q788 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms