Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAF7Q6Q0C0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms