Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTR9Q6PD62 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTR9Q6PD62 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms