Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMOD2Q6P5Q4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD2Q6P5Q4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms