Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R18Q6NYC8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms