Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms