Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD40Q6AI12 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms