Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DUPD1Q68J44 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUPD1Q68J44 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUPD1Q68J44 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUPD1Q68J44 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUPD1Q68J44 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUPD1Q68J44 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUPD1Q68J44 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUPD1Q68J44 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUPD1Q68J44 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms