Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCTD16Q68DU8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCTD16Q68DU8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms