Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3L3Q68CJ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3L3Q68CJ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms