Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
E4F1Q66K89 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E4F1Q66K89 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms