Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USPL1Q5W0Q7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USPL1Q5W0Q7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms