Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms