Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BROXQ5VW32 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BROXQ5VW32 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms