Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AGAP6Q5VW22 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP6Q5VW22 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms