Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf53Q5VUE5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf53Q5VUE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms